面对同时射过来的三发破坏光线，小智和两只路卡利欧以三发波导弹迎击，轻松压制住破坏光线，并且命中了三神柱，成功击败了三神柱。
之后，小智一行人继续前进。
而在世界初始之树的内部，皮卡丘被梦幻带到这里来之后，就看到梦幻住的地方，堆着一大堆玩具，有壶壶喇叭，柯波朗陀螺，乘龙音乐盒等等。
听到小智的呼喊声之后，皮卡丘一秒钟都不想再在这里多待了，只想回到小智身边。
梦幻便和皮卡丘一起来找小智，很快，一人一鼠成功汇合，而梦幻也把小智被强风所吹走的帽子给捡了回来。
与此同时，保安三神柱也赶到了这里，梦幻急忙出面阻止，告诉三神柱说小智一行人不是坏人，三神柱这才放过了小智一行人。
之后，梦幻带着小智一行人来到了世界初始之树的心脏处。
小智刚一进门，就看到有一双手套挂在地上的一根水晶柱子上，那旁边还隐隐约约地有一个人影。
见到这一幕，亚朗的路卡利欧瞬间就不淡定了，急忙跑上前去，因为那双手套正是亚朗戴着的手套，而那个隐隐约约的人影，也很像亚朗。
路卡利欧用波导之力进行查探，发现正是亚朗没错。
这时，小智发现旁边有一朵时间之花，就走上前去触摸，时间之花便将之前亚朗来到这里的画面投影了出来。
只见一百年前，亚朗在封印了路卡利欧之后，只身来到这里，喊道，
“梦幻，快出来。”
听到亚朗的呼喊，凤王飞了进来，然后变成了梦幻的本来模样。
我去，梦幻你居然cos摄影师，小智吐槽道。
“梦幻，我知道你和世界初始之树是一体的，所以，使用你的力量吧。”亚朗道。
梦幻点点头答应。
“波导之力，存于我心。接受我的波导之力吧！”
亚朗说着，伸出手，将自己身上的波导之力传输给梦幻。
到了这里，画面就结束了。
“亚朗牺牲了他自己的生命来平息了战争，真相一定是这样的。”小刚道。
“所以他之所以会封印路卡利欧，是因为不想让路卡利欧受到伤害。”小遥道。
“亚朗大人！”路卡利欧跪了下去，留下了悔恨的泪水，却意外地触碰到了另外一朵时间之花。
另一个画面被投影了出来。
画面中，亚朗已经用尽了自身的波导之力，让这片大地恢复了和平，但亚朗自身却是虚弱无比，靠在一块水晶上，开口道，
“路卡利欧，对不起，把你封印起来是不得已而为之，不然的话，我到哪里你都会跟我一起，也就会和我有同样的命运了吧，用生命来交换一场毫无意义的战争终止，我一个人便足够了，
但是，我并没有遗憾，我在城堡里度过了和琳恩陛下与你的美好时光，那才是活着的证明，
谢谢你，路卡利欧，和你一起度过的每一天，我都非常开心，路卡利欧，可以的话，再一次，我希望能再一次与你见面，我的朋友啊。”
说完，亚朗的生命便是终结了，消失在了画面里，而时间之花的画面也到此结束了。
“亚朗大人，亚朗大人，对不起，我竟然还怀疑你抛弃了我和城堡，我真是愚蠢，亚朗大人。”
看到这一幕，路卡利欧的眼角流下的泪水，整个人跪倒在地上，双手支撑着地面，无比的自责。
小智想要安慰，却又不知该如何安慰。
最后，路卡利欧下定决心，要替亚朗守护好这片土地。
至此，事情全部解决，路卡利欧的心结被解开了，小智也找回了皮卡丘，众人准备离开这里，返回城堡。
在此之前，梦幻单独把小智带到一处没人的地方。
“终焉神殿基因大厅厅主变幻之神梦幻之子，参见传承者大人。”
“嗯，免礼。”
“多谢传承者大人。”
“梦幻啊，你与这棵世界初始之树是共生关系，也就是说，你是这棵树的守护神咯。”
“大人说得没错，
还有，这个是阿尔宙斯大人当年放在世界初始之树这里的，说是如果有合适的传承者到来，便将这个石板交给他，属下现在便履行职责，请大人收下。”
梦幻递给小智一块棕红色的石板。
“叮！检测到宿主获得重要物品。”
【名称：拳头石板
说明：阿尔宙斯十八属性石板之一，让宝可梦携带后，可以增强格斗属性招式的威力，提升到原来的1.2倍。】
“好，我收下了。”
“那么我送大人离开吧。”
“好。”
接过石板，告别了梦幻，小智与众人汇合，回到了城堡里，艾琳殿下早已在城门口等候迎接。
听说了亚朗为了保护路卡利欧而牺牲自己一个人之后，艾琳殿下也是连连叹息。
最后，路卡利欧留在城堡里，担任波导的勇者一职，寻找接班人，同时也负责守护城堡的和平。
艾琳殿下则将那套勇者的衣服赠送给小智，作为对小智的谢礼。
路卡利欧则把那双亚朗的手套送给了小智。
“小智，这是亚朗大人的手套，应该可以帮到你。”路卡利欧道。
“谢谢你，路卡利欧。”
“小智，你拥有和亚朗大人一样的波导，是一位天生的波导的勇者，要加油啊，我会在城堡里为你祈祷，祝你早日达成你的梦想。”路卡利欧道。
“放心吧，我一定会成为一名优秀的波导使者的，
波导之力，永存我心！”小智道。
说完，小智和路卡利欧互相伸出拳头，碰了一下。
并且亚朗的路卡利欧也传授给了小智的路卡利欧不少战斗和使用波导的技巧，使得本就很强的路卡利欧，战斗力更上一层楼。
之后，琪朵来找小智一行人告别，离开欧鲁德朗城之后，琪朵去了法恩斯，跟巴特勒和黛安两人一起，调查和建设法恩斯去了，这是后话。
告别了艾琳殿下和路卡利欧，小智一行人乘坐缆车离开了欧鲁德朗城，往对战工厂的方向赶去。